RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKDCC-208	ENST00000490302	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PKDCC-208	ENST00000490302		H3BVH4	76 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKDCC-208	ENST00000490302	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PKDCC-208	ENST00000490302		B4DEV8	164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A087WWL8	130 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	CXorf1	O96002	111 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	MB	P02144	154 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	CRP	P02741	224 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	ENHO	Q6UWT2	76 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	SFRP2	Q96HF1	295 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	UBE2D3	P61077	147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	UBE2D2	P62837	147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A1W2PRE2	83 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	USP17L23	D6RBM5	183 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302		M0R036	132 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	IFNA7	P01567	189 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	CRIP1	P50238	77 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	SERF2	P84101	59 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302		Q86TA4	180 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PKDCC-208	ENST00000490302	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302		M0R381	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	HLA-DQA1	P01909	254 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	PEX7	O00628	323 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	SH2D1A	O60880	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	PRSS1	P07477	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	MT1HL1	P0DM35	61 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	MPV17L2	Q567V2	206 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	ZFP82	Q8N141	532 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	UBE2G2	P60604	165 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	MIA	Q16674	131 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	PKIA	P61925	76 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302		Q5BKY6	102 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302		Q6ZRU5	148 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302		A0A0D9SG52	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	PANO1	I0J062	215 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	RAB4B	P61018	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKDCC-208	ENST00000490302	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	UBE2G1	P62253	170 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF56	Q15929	161 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	PRR34	Q9NV39	138 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	PRR27	Q6MZM9	219 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302		G3V3Q6	166 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	RBX1	P62877	108 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PKDCC-208	ENST00000490302	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.6 ms