RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489476.5

TPRKB-209, Transcript of TP53RK binding protein, human

TSL 5

Gene TPRKB, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRKB-209	ENST00000489476	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TPRKB-209	ENST00000489476	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TPRKB-209	ENST00000489476	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TPRKB-209	ENST00000489476	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476		A8MWV9	139 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	MED6	O75586	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	TERB2	Q8NHR7	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	CAV2	P51636	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	S100A10	P60903	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	RBX1	P62877	108 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LITAF	Q99732	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	CSN1S1	P47710	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	PDE6H	Q13956	83 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476		A0A1B0GVG6	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476		A0A1W2PNN7	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476		H3BP45	60 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	MXD1	Q05195	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	TSKU	Q8WUA8	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476		K7EPK0	472 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	SS18	Q15532	418 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476		Q6ZRG5	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	PTH2	Q96A98	100 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	S100A14	Q9HCY8	104 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476		A0A0B4J2A0	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	SULT1A2	P50226	295 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	UBE2D3	P61077	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	UBE2D2	P62837	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TPRKB-209	ENST00000489476	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476		F6UZH7	168 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	SYNGR2	O43760	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	SDC2	P34741	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	PFDN5	Q99471	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476		A0A087X002	238 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	PYY	P10082	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	FGF6	P10767	208 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	CD3D	P04234	171 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TPRKB-209	ENST00000489476	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.5	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms