RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 RBFOX3A6NFN3 312 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SDHAF1A6NFY7 115 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SNRPGP15A8MWD9 76 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A8MWP4 228 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 GGTLC3B5MD39 225 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DISC1C4P0D8 188 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 I3L2K1 104 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 K7ERS5 55 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 UPK2O00526 184 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CRXO43186 299 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SYNGR2O43760 224 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ATG12O94817 140 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CRYZL1O95825 349 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IL5P05113 134 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AKAIN1P0CW23 69 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HTN3P15516 51 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS2R20P59543 309 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP12-4P60329 112 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PLGLAQ15195 96 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RGS21Q2M5E4 152 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM128Q5BJH2 165 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TRIQKQ629K1 86 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 AMTNQ6UX39 209 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SCXQ7RTU7 201 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LHFPL1Q86WI0 220 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TOMM5Q8N4H5 51 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TERB2Q8NHR7 220 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LGALS14Q8TCE9 139 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MITD1Q8WV92 249 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 GALMQ96C23 342 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ANAPC13Q9BS18 74 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35B3Q9H1N7 401 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2D2Q9H210 308 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 MIXL1Q9H2W2 232 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 COMMD3Q9UBI1 195 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa1.39□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A8MTW9 85 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM25AB3EWG3 89 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM25CB3EWG5 89 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM25GB3EWG6 89 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BMM0 161 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FABP7O15540 132 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LYRM1O43325 122 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 HPGDSO60760 199 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFB6O95139 128 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CDS2O95674 445 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DHFRP00374 187 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PET100P0DJ07 73 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IL7P13232 177 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LGALS7P47929 136 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 INPP1P49441 399 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 EMP1P54849 157 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10A3P58181 314 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 GNG2P59768 71 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CATR1Q13166 79 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ACTL10Q5JWF8 245 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TOMM20LQ6UXN7 152 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 SSX7Q7RTT5 188 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TCF24Q7RTU0 167 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5H6Q8NGV6 325 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR10J5Q8NHC4 309 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 VSTM2AQ8TAG5 236 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NEK7Q8TDX7 302 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 BLNKQ8WV28 456 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC30Q96LL9 226 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM56Q96MV1 263 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PHB2Q99623 299 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 UPK3BQ9BT76 320 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PECRQ9BY49 303 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 ATG5Q9H1Y0 275 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 IFT46Q9NQC8 304 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 COMMD9Q9P000 198 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa1.38□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A096LPF7 62 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GXF2 115 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM235A6NFC5 223 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 OR4C46A6NHA9 309 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 FNDC10F2Z333 226 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 J3QRK9 145 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR31O00270 319 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA4O00483 81 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PLA2G10O15496 165 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 PPYP01298 95 aa1.37□□□□□ -2.19
RABGGTB-211ENST00000489450 TCRBP04435 133 aa1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms