RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487507.1

SGIP1-212, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SGIP1, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-212ENST00000487507 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.42□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.42□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 SUN5Q8TC36 379 aa7.42□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 H3BVH4 76 aa7.41□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.41□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 PKIAP61925 76 aa7.41□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 CTF1Q16619 201 aa7.41□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 DIRC1Q969H9 104 aa7.41□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.41□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.4□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa7.4□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 C9orf170A2RU37 121 aa7.4□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.4□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 CDIP1Q9H305 208 aa7.4□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.4□□□□□ -1.22
SGIP1-212ENST00000487507 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.39□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.39□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 Q9H521 79 aa7.39□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.39□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 P01737 135 aa7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 THAP6Q8TBB0 222 aa7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 OTORQ9NRC9 128 aa7.38□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 H0Y9J4 135 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 M0R381 172 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 GHRHP01286 108 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.37□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.37□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.36□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 CFAP161Q6P656 301 aa7.36□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.36□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 TRIM63Q969Q1 353 aa7.36□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.35□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 IGLV7-43P04211 117 aa7.35□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.35□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 S100A11P31949 105 aa7.35□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 GAGE2BQ13066 116 aa7.35□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 ZNF56Q15929 161 aa7.35□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 AMTP48728 403 aa7.34□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 SULT1A1P50225 295 aa7.34□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 SULT1A2P50226 295 aa7.34□□□□□ -1.23
SGIP1-212ENST00000487507 PRR27Q6MZM9 219 aa7.34□□□□□ -1.23
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SGIP1-212ENST00000487507 HBG2P69892 147 aa7.33□□□□□ -1.24
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SGIP1-212ENST00000487507 B4DEV8 164 aa7.32□□□□□ -1.24
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SGIP1-212ENST00000487507 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.31□□□□□ -1.24
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SGIP1-212ENST00000487507 CRYGAP11844 174 aa7.31□□□□□ -1.24
SGIP1-212ENST00000487507 PTTG1IPP53801 180 aa7.31□□□□□ -1.24
SGIP1-212ENST00000487507 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.31□□□□□ -1.24
SGIP1-212ENST00000487507 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.31□□□□□ -1.24
SGIP1-212ENST00000487507 A0A087WXM4 84 aa7.3□□□□□ -1.24
SGIP1-212ENST00000487507 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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