RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF56Q15929 161 aa12.37□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 LY6G5BQ8NDX9 201 aa12.37□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa12.37□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 IGF1P05019 195 aa12.37□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 RPL39P62891 51 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.37□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 G3V318 75 aa12.36□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N1Y9 231 aa12.35□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2D1P51668 147 aa12.35□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C15orf32Q32M92 178 aa12.35□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.35□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0J9YY99 117 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CTSGP08311 255 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C19orf84I3L1E1 186 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 UCNP55089 124 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 A0A087WWL8 130 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CD7P09564 240 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2D3P61077 147 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2D2P62837 147 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf82Q6UX34 121 aa12.34□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.33□□□□□ -0.43
CCSAP-204ENST00000483092 IGHG4P01861 327 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SAA4P35542 130 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 RHODO00212 210 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GNLYP22749 145 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.33□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SLC50A1Q9BRV3 221 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TOMM6Q96B49 74 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 M0R1W7 72 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DUX3Q96PT4 197 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 RNF5Q99942 180 aa12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ATP6V0E1O15342 81 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NACAE9PAV3 2078 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ODF3BA8MYP8 253 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 J3QQQ9 107 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GNRH2O43555 120 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ASIPP42127 132 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NPBQ8NG41 125 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.31□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 F8W735 103 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CNFNQ9BYD5 112 aa12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 LY6EQ16553 131 aa12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF575Q86XF7 245 aa12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.3□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 METTL26Q96S19 204 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 JPT2Q9H910 190 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 H3BMM0 161 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ATXN8Q156A1 80 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01620Q4KN68 170 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2WQ96B02 151 aa12.29□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 F6UB75 175 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SRD5A1P18405 259 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 Q8N9W7 124 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IGKV3-20P01619 116 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-30P01768 117 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PMVKQ15126 192 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 LRRK2Q5S007 2527 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TLN2Q9Y4G6 2542 aa12.28□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ELANEP08246 267 aa12.27□□□□□ -0.44
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0U1RRA0 63 aa12.27□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PRR9Q5T870 116 aa12.27□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CITED1Q99966 193 aa12.27□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SPXQ9BT56 116 aa12.27□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.27□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 BUB3O43684 328 aa12.27□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 OR10J6PQ8NGY7 276 aa12.27□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 HTN1P15515 57 aa12.26□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SIRPDQ9H106 197 aa12.25□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RBAKDNA6NC62 111 aa12.25□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.25□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-11P01762 117 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 IGHV3-33P01772 117 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 COX6CP09669 75 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC2BQ92478 149 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ABCA12Q86UK0 2595 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 LINC01546A6NGU7 62 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ID1P41134 155 aa12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ZANQ9Y493 2812 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms