RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RHOHQ15669 191 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UFSP1Q6NVU6 142 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COMMD7Q86VX2 200 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC00476Q8WZB0 136 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BORCS7Q96B45 105 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CNFNQ9BYD5 112 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 JPT2Q9H910 190 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 V9GYV3 84 aa13.51□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CTRLP40313 264 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RAB4BP61018 213 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.5□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 F8W036 122 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SSTP61278 116 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEGR1Q7Z3B1 354 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GTSF1Q8WW33 167 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AP1S3Q96PC3 154 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NACAE9PAV3 2078 aa13.49□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A096LPF7 62 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MT-ND4LP03901 98 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GYPEP15421 78 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TWIST1Q15672 202 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANAPC16Q96DE5 110 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SEC11CQ9BY50 192 aa13.48□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A087WWL8 130 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 K7EQD1 137 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SRIP30626 198 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.47□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.46□□□□□ -0.25
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A1B0GUT8 65 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HIGD1CA8MV81 97 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.45□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CSMD3Q7Z407 3707 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 F5H697 171 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RIGQ13278 110 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ESRGQ1W209 222 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 Q6ZSN1 163 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TENM2Q9NT68 2774 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 H7C1H1 209 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TIRAPP58753 221 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF56Q15929 161 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LYPD5Q6UWN5 251 aa13.43□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EVI2AP22794 236 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC00315P59091 139 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NUP35Q8NFH5 326 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FRZBQ92765 325 aa13.42□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STARD9Q9P2P6 4700 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A1B0GW15 77 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C10orf91Q5T1B1 145 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC00588Q9Y4M8 146 aa13.41□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CTDSP1Q9GZU7 261 aa13.4□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 S100A8P05109 93 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UPK3BQ9BT76 320 aa13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GAGE12JA6NER3 117 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADCYAP1P18509 176 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GAGE1Q13065 139 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GAGE4Q13068 117 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GAGE5Q13069 117 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GAGE13Q4V321 117 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IMMP2LQ96T52 175 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.38□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MGPP08493 103 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 Q9H8V8 135 aa13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A087WWC5 75 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 M0QY20 66 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NDUFA5Q16718 116 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.36□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RASL11AQ6T310 242 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NIT2Q9NQR4 276 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC00694P0DN24 101 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SUMO4Q6EEV6 95 aa13.34□□□□□ -0.27
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms