RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf90	A8MZG2	172 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	CRYGD	P07320	174 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf52	Q96A22	123 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	MLST8	Q9BVC4	326 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	VAX2	Q9UIW0	290 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-30	P01768	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-33	P01772	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF56	Q15929	161 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	SFRP2	Q96HF1	295 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	CEBPG	P53567	150 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	BLOC1S1	P78537	153 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880		F5H697	171 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	MED14OS	P0DP75	135 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	GZMB	P10144	247 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	LELP1	Q5T871	98 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	NFE4	Q86UQ8	179 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880		Q9HAA7	133 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	EREG	O14944	169 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880		P01737	135 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM17	P0DL12	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	TIRAP	P58753	221 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880		Q9UF83	564 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	PSCA	O43653	123 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	CXCL1	P09341	107 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	ERVFC1-1	P60608	527 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	XKRY2	A2RUG3	117 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880		K7EP13	123 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	IGLV2-8	P01709	118 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	MGP	P08493	103 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	BIN3	Q9NQY0	253 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SSR4-208	ENST00000471880	SNAI2	O43623	268 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	OR5AL1	P0C617	328 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	AP1S3	Q96PC3	154 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WWC5	75 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	10.01	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	RAB4B	P61018	213 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	TOR2A	Q5JU69	321 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM12	Q96EX1	92 aa		10.01	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		10	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-2	P60368	255 aa		10	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		10	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880		Q8N3U1	123 aa		10	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00694	P0DN24	101 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	RYR1	P21817	5038 aa		9.99	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	CACNG7	P62955	275 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	OCC1	Q8TAD7	63 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT11	Q96G61	164 aa		9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WX48	190 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM262	E9PQX1	116 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM250	H0YL14	139 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	IGLC6	P0CF74	106 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2D3	P61077	147 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2D2	P62837	147 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
SSR4-208	ENST00000471880		A0A087WTM6	91 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880		F2Z2F3	143 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880		K7EN84	100 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	TRGC1	P0CF51	173 aa		9.96	□□□□□ -0.82
SSR4-208	ENST00000471880	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.8 ms