RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MLANAQ16655 118 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 ZMAT4Q9H898 229 aa5.96□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CD7P09564 240 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 HERV-K104P63124 156 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TDRG1Q3Y452 100 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CARD19Q96LW7 228 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 DUX3Q96PT4 197 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 LINC01587Q99440 93 aa5.95□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 C20orf78Q9BR46 151 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 GATD1Q8NB37 220 aa5.95□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 JMJD1CQ15652 2540 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MUC3AQ02505 3323 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 H3BT86 120 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CRLF1O75462 422 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 WFDC2Q14508 124 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 Q8N9W7 124 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 K7ERJ3 54 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 YPEL4Q96NS1 127 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 LINC00479Q96M42 142 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.94□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 G3V318 75 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 K7EIM0 57 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 K7EN84 100 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 INSP01308 110 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 LINC00158P58513 81 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 FXYD7P58549 80 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 FXYD5Q96DB9 178 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 K7EMT4 169 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 KRTAP10-9P60411 292 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.93□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 SMKR1H3BMG3 65 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 NPC2P61916 151 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 PATE2Q6UY27 113 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IL17DQ8TAD2 202 aa5.93□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 J3QQQ9 107 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 ZNF876PQ49A33 203 aa5.92□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TMEM213A2RRL7 107 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 H3BRN7 92 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 LTAP01374 205 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 PAX4O43316 350 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 Q6ZUT4 128 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 PCP2Q8IVA1 136 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.92□□□□□ -1.46
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USP54-210ENST00000466048 ZNF503Q96F45 646 aa5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 UQCRQO14949 82 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGF1P05019 195 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 KLK9Q2XQG4 91 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 RNF183Q96D59 192 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 LINC01620Q4KN68 170 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 PIFOQ8TCI5 191 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 DKK2Q9UBU2 259 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.91□□□□□ -1.46
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