RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CUL7Q14999 1698 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 IFNA17P01571 189 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 AKAIN1P0CW23 69 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 IQCJQ1A5X6 159 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC01545Q5VT33 79 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SCIMPQ6UWF3 145 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ACBD7Q8N6N7 88 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PP6455Q8WZ26 134 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SPANXDQ9BXN6 97 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ATG5Q9H1Y0 275 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SCN3BQ9NY72 215 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF609O15014 1411 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 MBD5Q9P267 1494 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 RREB1Q92766 1687 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R143 59 aa1.56□□□□□ -2.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 TFF1P04155 84 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC25A6P12236 298 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 MEIG1Q5JSS6 88 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00575Q6W349 94 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 COPS9Q8WXC6 57 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMB1P07942 1786 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 MYOM2P54296 1465 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 LAMA4Q16363 1823 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM218A2RU14 115 aa1.55□□□□□ -2.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 BTG2P78543 158 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 DPH3Q96FX2 82 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 HIGD1CA8MV81 97 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 TPPP2P59282 170 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD3Q14802 87 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 XAF1Q6GPH4 301 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNRGQ8N5I3 272 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPKBP1O60336 1514 aa1.54□□□□□ -2.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 A2ML1A8K2U0 1454 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 CCKP06307 115 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 PZPP20742 1482 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 Q6ZQY7 126 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 NRKQ7Z2Y5 1582 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 CCL19Q99731 98 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.53□□□□□ -2.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa1.53□□□□□ -2.16
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RABGGTB-205ENST00000462042 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-205ENST00000462042 BCORL1Q5H9F3 1711 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC179H3BU77 68 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TNFP01375 233 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 C5orf56Q8N8D9 126 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NAA60Q9H7X0 242 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 RPRMQ9NS64 109 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PHIPQ8WWQ0 1821 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 KNTC1P50748 2209 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ABCC10Q5T3U5 1492 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PIRTP0C851 137 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 HSD52Q0P140 79 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NCMAPQ5T1S8 102 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00208Q96KT6 92 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 QRICH2Q9H0J4 1663 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CFTRP13569 1480 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 Q56UQ5 140 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SPANXN1Q5VSR9 72 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2T2Q6IF00 324 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFA11Q86Y39 141 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SVBPQ8N300 66 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 Q8N6K4 173 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa1.49□□□□□ -2.17
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RABGGTB-205ENST00000462042 S100A10P60903 97 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CATR1Q13166 79 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 Q86TA4 180 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 IFI27L1Q96BM0 104 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC11CQ9BY50 192 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-205ENST00000462042 Q9H521 79 aa1.49□□□□□ -2.17
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