RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
NISCH-203ENST00000460759 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-203ENST00000460759 MUC4Q99102 2169 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-203ENST00000460759 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.34□□□□□ -0.91
NISCH-203ENST00000460759 RHODO00212 210 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 SAMD5Q5TGI4 173 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.33□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.33□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 TMEM18Q96B42 140 aa9.32□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 KRTAP10-11P60412 298 aa9.31□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 C20orf78Q9BR46 151 aa9.3□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.29□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 NRACQ8N912 160 aa9.29□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 A0A087WWL8 130 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.28□□□□□ -0.92
NISCH-203ENST00000460759 F5H697 171 aa9.28□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.28□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.28□□□□□ -0.92
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NISCH-203ENST00000460759 FABP4P15090 132 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.27□□□□□ -0.93
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NISCH-203ENST00000460759 X6R8D5 127 aa9.27□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa9.26□□□□□ -0.93
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NISCH-203ENST00000460759 IFITM10A6NMD0 228 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 AMTP48728 403 aa9.26□□□□□ -0.93
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NISCH-203ENST00000460759 UFSP1Q6NVU6 142 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 Q8N8P6 123 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
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NISCH-203ENST00000460759 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 OR4C5Q8NGB2 326 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 C18orf15Q96N68 181 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 ST20Q9HBF5 79 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 TGP01266 2768 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 M0QY20 66 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 TCAPO15273 167 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 IGHV3-53P01767 116 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
NISCH-203ENST00000460759 Q6ZTI0 123 aa9.24□□□□□ -0.93
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