RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460589.5

RPL3-208, Transcript of ribosomal protein L3, human

TSL 2

Gene RPL3, Length 630 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL3-208	ENST00000460589	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	TM2D2	Q9BX73	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589		Q9UF83	564 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	GCG	P01275	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	IFNA1	P01562	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	AKR1C3	P42330	323 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	UBE2G1	P62253	170 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	CCL20	P78556	96 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589		Q86TA4	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	BAALC	Q8WXS3	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RPL3-208	ENST00000460589	CIDEA	O60543	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	SYT8	Q8NBV8	401 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	OXT	P01178	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	PTH2	Q96A98	100 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	GAGE12J	A6NER3	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	LTA	P01374	205 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	GAGE1	Q13065	139 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	GAGE4	Q13068	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	GAGE5	Q13069	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	GAGE13	Q4V321	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	PDE6D	O43924	150 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	BCL2	P10415	239 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	PARL	Q9H300	379 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	JPT2	Q9H910	190 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	RNF213	Q63HN8	5207 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RPL3-208	ENST00000460589	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		11.08	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	LRP2	P98164	4655 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	NIT1	Q86X76	327 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589		Q8N976	141 aa		11.07	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	SH2D1A	O60880	128 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	CRIP1	P50238	77 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	COX11	Q9Y6N1	276 aa		11.06	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589		B4DEV8	164 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	DERL1	Q9BUN8	251 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	TNXB	P22105	4242 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589		A0A087WWC5	75 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589		A8MWV9	139 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	ASIP	P42127	132 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	ATRAID	Q6UW56	229 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RPL3-208	ENST00000460589	KLK12	Q9UKR0	248 aa		11.04	□□□□□ -0.64

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