RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C14orf177Q52M58 125 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SFRP2Q96HF1 295 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AQP10Q96PS8 301 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 H3BVH4 76 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CRIP1P50238 77 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DEFA1P59665 94 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DEFA3P59666 94 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2WQ96B02 151 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PEX7O00628 323 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2D3P61077 147 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2D2P62837 147 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q86TA4 180 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IFNA7P01567 189 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LINC01559Q495D7 138 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A0A087WWL8 130 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FAM74A7A6NL05 159 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 M0R036 132 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SH2D1AO60880 128 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZNF726P1Q15940 193 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ENHOQ6UWT2 76 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZFP82Q8N141 532 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FMC1Q96HJ9 113 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRP2P98164 4655 aa6.65□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 M0R381 172 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RAB4BP61018 213 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PKIAP61925 76 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MIAQ16674 131 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ALG5Q9Y673 324 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 A6NHS1 94 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM262E9PQX1 116 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LTAP01374 205 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CRPP02741 224 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TNXBP22105 4242 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FHITP49789 147 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2G2P60604 165 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRR27Q6MZM9 219 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 USP17L23D6RBM5 183 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CXCL1P09341 107 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 UBE2G1P62253 170 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MPV17L2Q567V2 206 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRR34Q9NV39 138 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MED28Q9H204 178 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VAX2Q9UIW0 290 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTTG1O95997 202 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PRSS1P07477 247 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 Q5BKY6 102 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SNAI2O43623 268 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HLA-DQA1P01909 254 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OR5AL1P0C617 328 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms