RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PDZD2O15018 2839 aa14.05□□□□□ -0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM19A4Q96LR4 140 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP1-202ENST00000417536 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa14.04□□□□□ -0.16
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SH3BP1-202ENST00000417536 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01356Q8N9X3 169 aa13.94□□□□□ -0.18
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM74A4Q5TZK3 123 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 DCANP1Q8TF63 244 aa13.94□□□□□ -0.18
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SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.93□□□□□ -0.18
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SH3BP1-202ENST00000417536 IGIPA6NJ69 53 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV4-31P0DP07 118 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 KIR2DL4Q99706 377 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QKU1 62 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE13Q4V321 117 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 SFTA2Q6UW10 78 aa13.91□□□□□ -0.18
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