RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RIPPLY3P57055 190 aa4□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCGB2A2Q13296 93 aa4□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RHOHQ15669 191 aa4□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C4orf3Q8WVX3 66 aa4□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TIMM17AQ99595 171 aa4□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIR2DL4Q99706 377 aa4□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BATFQ16520 125 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXC2Q99958 501 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TM2D2Q9BX73 214 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CYSLTR1Q9Y271 337 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NAV2Q8IVL1 2488 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.99□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRK2Q5S007 2527 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MUC21A0A140T8X8 626 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CBY3A6NI87 242 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 E9PLD3 99 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTTG1IPP53801 180 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MUC21Q5SSG8 566 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 AMTNQ6UX39 209 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM160Q9NX00 188 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DKK2Q9UBU2 259 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTPN13Q12923 2485 aa3.98□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP24Q9UPU5 2620 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGIPA6NJ69 53 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A8MWV9 139 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 M0QY20 66 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RHODO00212 210 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GNRH2O43555 120 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CIDEAO60543 219 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GAS8-AS1O95177 125 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CRYGDP07320 174 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CD7P09564 240 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TFPI2P48307 235 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SYNJ2BPP57105 145 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FHL3Q13643 280 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPXQ9BT56 116 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C16orf95Q9H693 158 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.97□□□□□ -1.77
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A1B0GWB2 263 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OR11H12B2RN74 326 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 F6UB75 175 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H0Y8G0 127 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H3BMM0 161 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCL25O15444 150 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF688P0C7X2 276 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NMUP48645 174 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HERVK_113P61574 105 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GAGE13Q4V321 117 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OR11H1Q8NG94 326 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OR11H2Q8NH07 326 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BAALCQ8WXS3 180 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSTL1Q9H114 145 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM208BQ5VWN6 2430 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.96□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRSS29PA6NIE9 313 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C11orf86A6NJI1 115 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 I3L3M4 83 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 M0R2P5 195 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMIM13P0DJ93 91 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PMVKQ15126 192 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 VAMP3Q15836 100 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DEFB114Q30KQ6 69 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM95Q3KNT9 176 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF876PQ49A33 203 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZQT7 251 aa3.95□□□□□ -1.78
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NFE4Q86UQ8 179 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms