RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYBAP13498 195 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 UCHL3P15374 230 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLDN8P56748 225 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMAIP1Q13794 54 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDRT4Q8N9R6 151 aa-3.39□□□□□ -2.95
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CRIPTQ9P021 101 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIGD1BQ9P298 99 aa-3.39□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALKQ9UM73 1620 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 I3L3M4 83 aa-3.4□□□□□ -2.95
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RNU6-172P-201ENST00000411000 M0R135 149 aa-3.4□□□□□ -2.95
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM17P0DL12 118 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADCYAP1P18509 176 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARPP19P56211 112 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2G2P60604 165 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTG2P78543 158 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLAMF1Q13291 335 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARP14Q460N5 1801 aa-3.4□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-3.41□□□□□ -2.95
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2BKO60814 126 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRHP06850 196 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H2BJP06899 126 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPCS2Q15005 226 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 STX19Q8N4C7 294 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC2BQ92478 149 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 TERF2IPQ9NYB0 399 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-3.41□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL22O00626 93 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNA6P05013 189 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIRTP0C851 137 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMBIM6P55061 237 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX17Q14061 63 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNM1P34Q6PK57 102 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 STX12Q86Y82 276 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHB2Q99623 299 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCC1Q9NVA1 299 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGI2Q86UL8 1455 aa-3.42□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa-3.43□□□□□ -2.96
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CLPSL1A2RUU4 121 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 C5orf58C9J3I9 102 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CALUO43852 315 aaPredicted RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL18P55774 89 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP5J2P56134 94 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP3S1Q92572 193 aa-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP-3.43□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf76Q96K31 380 aa-3.43□□□□□ -2.96
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-3.44□□□□□ -2.96
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-3.44□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-3.44□□□□□ -2.96
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RNU6-172P-201ENST00000411000 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPCAL4Q9UM19 191 aa-3.45□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPRMP28827 1452 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF236Q9UL36 1845 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 EVPLLA8MZ36 301 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 SUPT3HB4E1H0 165 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 CST8O60676 142 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V1G2O95670 118 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT-ND6P03923 174 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPT1P13693 172 aaKnown RBP-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSME3P61289 254 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAA20P61599 178 aa-3.46□□□□□ -2.96
RNU6-172P-201ENST00000411000 COTL1Q14019 142 aa-3.46□□□□□ -2.96
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