RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 MLST8Q9BVC4 326 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 C5orf38Q86SI9 138 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 NACAE9PAV3 2078 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 NDUFA7O95182 113 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 CTSGP08311 255 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 XCL1P47992 114 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 PLXNB1O43157 2135 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 M0QXV9 152 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 PRSS33Q8NF86 280 aa7.57□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 BUB3O43684 328 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.56□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 RNF138Q8WVD3 245 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 LHBP01229 141 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGLV2-23P01705 113 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 RNF152Q8N8N0 203 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 NFE4Q86UQ8 179 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.55□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 FAM236CP0DP71 79 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 A0A0J9YXY3 114 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 DEFB1P60022 68 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 KAAG1Q9UBP8 84 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 U3KQE9 123 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 A0A096LPF7 62 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 PROP1O75360 226 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 U3KQA8 63 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 A0A0J9YY99 117 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TEX22C9J3V5 150 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 MIAQ16674 131 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TNCP24821 2201 aa7.54□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 TRIAP1O43715 76 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZS92 163 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 B4DSR2 109 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.53□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 IGHV1-69P01742 117 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 SVIPQ8NHG7 77 aa7.52□□□□□ -1.2
HERC3-202ENST00000402738 V9GYY9 64 aa7.52□□□□□ -1.2
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HERC3-202ENST00000402738 LINC00694P0DN24 101 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 COX7A2LO14548 114 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-33P01772 117 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 UPK3BQ9BT76 320 aa7.52□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 NOTCH4Q99466 2003 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 TRBV12-3P01733 135 aa7.51□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 P0DMU3 169 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 FAM231AP0DMU4 169 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 FAM231CP0DMU5 169 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 NREPQ16612 68 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 LINC01619G3V211 115 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 F5H768 121 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 NPBQ8NG41 125 aa7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 CRIP1P50238 77 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 MED12LQ86YW9 2145 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 U3KQK5 164 aa7.49□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
HERC3-202ENST00000402738 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.49□□□□□ -1.21
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