RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 VPS13CQ709C8 3753 aa9.8□□□□□ -0.84
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PRAME-201ENST00000398741 IGHV4-59P01825 116 aa9.78□□□□□ -0.84
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PRAME-201ENST00000398741 DSCR9P59020 149 aa9.74□□□□□ -0.85
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PRAME-201ENST00000398741 Q8N1Y9 231 aa9.74□□□□□ -0.85
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PRAME-201ENST00000398741 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.73□□□□□ -0.85
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PRAME-201ENST00000398741 MUC4Q99102 2169 aa9.73□□□□□ -0.85
PRAME-201ENST00000398741 M0QY20 66 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-201ENST00000398741 RHOHQ15669 191 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-201ENST00000398741 ZNF876PQ49A33 203 aa9.72□□□□□ -0.85
PRAME-201ENST00000398741 A0A0J9YY99 117 aa9.71□□□□□ -0.85
PRAME-201ENST00000398741 ETDBQ3ZM63 59 aa9.71□□□□□ -0.85
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PRAME-201ENST00000398741 NRGNQ92686 78 aa9.71□□□□□ -0.85
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PRAME-201ENST00000398741 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.7□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 I3L3M4 83 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 J3QKU1 62 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 J3QLI3 93 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 J3QQQ9 107 aa9.69□□□□□ -0.86
PRAME-201ENST00000398741 TSPAN13O95857 204 aa9.69□□□□□ -0.86
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