RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384546.1

RNU6-1160P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1160, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1160P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1160P-201ENST00000384546 H3BQV1 296 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GNG5P63218 68 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZNF609O15014 1411 aa-3.79□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LRP6O75581 1613 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IFT172Q9UG01 1749 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MORN4Q8NDC4 146 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 IFI27L1Q96BM0 104 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LRTM1Q9HBL6 345 aa-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-3.8□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CETN3O15182 167 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CKS2P33552 79 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NPC2P61916 151 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PIGYQ3MUY2 71 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C3orf33Q6P1S2 294 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CARD19Q96LW7 228 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SDF2Q99470 211 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PRNDQ9UKY0 176 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZFYVE9O95405 1425 aa-3.81□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 G3V2T6 193 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 H7C1C5 153 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LCN6P62502 163 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 OTOSQ8NHW6 89 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BORCS8Q96FH0 119 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PAPPAQ13219 1627 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-3.82□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 WFDC6Q9BQY6 131 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 S100A3P33764 101 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 Q5VV11 94 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NUP35Q8NFH5 326 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NPVFQ9HCQ7 196 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AKR1D1P51857 326 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CROCCP2Q86T23 111 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NDUFA11Q86Y39 141 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 BRK1Q8WUW1 75 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LXNQ9BS40 222 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 C9orf16Q9BUW7 83 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB112Q30KQ8 113 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SSR3Q9UNL2 185 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AKAP13Q12802 2813 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC25A6P12236 298 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC00472Q9H8W2 130 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PPP1R2P41236 205 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 EDDM3BP56851 147 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ARF6P62330 175 aa-3.88□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PTPRMP28827 1452 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SMIM23A6NLE4 172 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CSN2P05814 226 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ERVS71-1P61550 626 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CFAP126Q5VTH2 177 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SLC25A26Q70HW3 274 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TEX29Q8N6K0 151 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LAMA3Q16787 3333 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 KNL1Q8NG31 2342 aa-3.89□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DOCK1Q14185 1865 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 DEFB105AQ8NG35 78 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LYSTQ99698 3801 aa-3.9□□□□□ -3.03
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SDC2P34741 201 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MED11Q9P086 117 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 MT1AP04731 61 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 GABARAPH6UMI1 98 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 J3KT08 172 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TPM3P06753 285 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CST2P09228 141 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 CRYGSP22914 178 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TEX15Q9BXT5 2789 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ZZEF1O43149 2961 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ACACAQ13085 2346 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 HBDP02042 147 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SPCS2Q15005 226 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 SPA17Q15506 151 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 LTC4SQ16873 150 aa-3.94□□□□□ -3.04
RNU6-1160P-201ENST00000384546 ARMC1Q9NVT9 282 aa-3.94□□□□□ -3.04
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