RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 FLNCQ14315 2725 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 M0R1W7 72 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 CD7P09564 240 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 KLK9Q2XQG4 91 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01600Q96MT4 127 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 BUB3O43684 328 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 CTSGP08311 255 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 P0DMU3 169 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 FAM231AP0DMU4 169 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 FAM231CP0DMU5 169 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 LYNX1P0DP58 116 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 COX7A1P24310 79 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 INSL3P51460 131 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 XGP55808 180 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE2BQ13066 116 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE2EQ4V326 116 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 NFE4Q86UQ8 179 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF575Q86XF7 245 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 BAALCQ8WXS3 180 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.47□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 RELNP78509 3460 aa5.46□□□□□ -1.53
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf86A6NJI1 115 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 RHODO00212 210 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 IGHG4P01861 327 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 MT-ATP8P03928 68 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 DSCR9P59020 149 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 PMVKQ15126 192 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 TTC32Q5I0X7 151 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 IL17DQ8TAD2 202 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00477Q96M19 166 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 METTL26Q96S19 204 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 AGRNO00468 2067 aa5.46□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0B4J2C4 111 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 TRGV3P03979 118 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 HES1Q14469 280 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 MINOS1Q5TGZ0 78 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 TIMM17AQ99595 171 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0J9YY99 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE12JA6NER3 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 OVOL1O14753 267 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A20O43772 301 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE7O76087 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 LY6HO94772 140 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE12FP0CL80 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE12GP0CL81 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE12IP0CL82 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GAGE4Q13068 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 EBI3Q14213 229 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 ATXN8Q156A1 80 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 CITED1Q99966 193 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 ONECUT1Q9UBC0 465 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.45□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 PLXNB1O43157 2135 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 GAS8-AS1O95177 125 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 TCL1BO95988 128 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV4-39P01824 125 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 IFITM1P13164 125 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 ATP5J2P56134 94 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 RNF183Q96D59 192 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 KIR2DL4Q99706 377 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 SPANXCQ9NY87 97 aa5.44□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087WW49 117 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 ODF3BA8MYP8 253 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 H3BVH4 76 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-30P01768 117 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 PRTN3P24158 256 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5.43□□□□□ -1.54
CTPS1-201ENST00000372616 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.9 ms