RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 RASL10AQ92737 203 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 A0A087WWL8 130 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 PLAC8L1A1L4L8 177 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB4AO15263 64 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 DEFA6Q01524 100 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZTI0 123 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 CIDEAO60543 219 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB130BP0DP73 79 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 DEFB130AP0DP74 79 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 CKS2P33552 79 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 RAB5BP61020 215 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 B9D2Q9BPU9 175 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 JPT2Q9H910 190 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 MUC4Q99102 2169 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 RS1O15537 224 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 PPBPP02775 128 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 RAB4AP20338 218 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 DAD1P61803 113 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 SLAQ13239 276 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 MRAP2Q96G30 205 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PTPRK-201ENST00000368202 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 H7C1H1 209 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-53P01767 116 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 ORMDL3Q8N138 153 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 DKK2Q9UBU2 259 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 D6R8Y8 96 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 PPP1R17O96001 155 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 CRYGDP07320 174 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 RNF185Q96GF1 192 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0J9YWU9 116 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 SRIP30626 198 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 PRELID3AQ96N28 172 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 NOTCH1P46531 2555 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 NCR2O95944 276 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 ATP5G1P05496 136 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF479Q96JC4 524 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 C18orf15Q96N68 181 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 CELA1Q9UNI1 258 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 SMKR1H3BMG3 65 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 S100A6P06703 90 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 TNFRSF6BO95407 300 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 HTN3P15516 51 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 U3KQK5 164 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 K7EQD1 137 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 PHOX2AO14813 284 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 NPYP01303 97 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFA6P56556 154 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00315P59091 139 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 BAGE3Q86Y29 109 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 ST20Q9HBF5 79 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 NIT2Q9NQR4 276 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-201ENST00000368202 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 F5H768 121 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BKO60814 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BJP06899 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BOP23527 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BBP33778 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BDP58876 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BCP62807 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 RHOHQ15669 191 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-201ENST00000368202 M0QY20 66 aa8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.3 ms