RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365367.1

RNU6-53P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 53, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-53P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-53P-201ENST00000365367 C22orf42Q6IC83 251 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINC00337Q8N6G1 96 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TSPAN14Q8NG11 270 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR10G9Q8NGN4 311 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR10G8Q8NGN5 311 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR2G3Q8NGZ4 309 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR1S1Q8NH92 325 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 GPX8Q8TED1 209 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FXYD5Q96DB9 178 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 KCNS1Q96KK3 526 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 CARD19Q96LW7 228 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 GPR82Q96P67 336 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 CHCHD7Q9BUK0 85 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM147Q9BVK8 224 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 SRRQ9GZT4 340 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM107BQ9H098 131 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 DAPK2Q9UIK4 370 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 AP4S1Q9Y587 144 aa0.6□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 A0A087WWC5 75 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 PGPA6NDG6 321 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FABP12A6NFH5 140 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 H3BVH4 76 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 K7EPK0 472 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 WRBO00258 174 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MYL12BO14950 172 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 AGPAT2O15120 278 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 PAGE4O60829 102 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 IL5P05113 134 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 NMBP08949 121 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 PGAM2P15259 253 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MYL12AP19105 171 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FGF7P21781 194 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MT4P47944 62 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 RPL37P61927 97 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 AKR1C1Q04828 323 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MXD1Q05195 221 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 SYCNQ0VAF6 134 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 ELOBQ15370 118 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 IQCJQ1A5X6 159 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 IDNKQ5T6J7 187 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM74A4Q5TZK3 123 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 ETFRF1Q6IPR1 90 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 STEAP1BQ6NZ63 245 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q6Q795 121 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM159AQ6UWV7 190 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 COX6B2Q6YFQ2 88 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZFP2Q6ZN57 461 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q6ZVH6 145 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MIR17HGQ75NE6 70 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 CROCCP2Q86T23 111 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 Q8NDZ9 215 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 LRRC20Q8TCA0 184 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 ASB13Q8WXK3 278 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 UFD1Q92890 307 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM104AQ969W3 186 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 PTH2Q96A98 100 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 SFRP2Q96HF1 295 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 CHCHD5Q9BSY4 110 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 PDCD10Q9BUL8 212 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 MND1Q9BWT6 205 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 C11orf1Q9H5F2 150 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 NAA60Q9H7X0 242 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 ENY2Q9NPA8 101 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 COMMD3Q9UBI1 195 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 SSR3Q9UNL2 185 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 PXMP4Q9Y6I8 212 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 U3KQ87 197 aa0.59□□□□□ -2.31
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRAV6A0A075B6T7 132 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 A0A0A6YYH2 397 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 MUC21A0A140T8X8 626 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 GRIFINA4D1Z8 144 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 METTL21EPA6NDL7 271 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 A6NJ64 397 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 SNTNA6NMZ2 147 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 A6NN06 94 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 PTGES3LE9PB15 166 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 GABARAPH6UMI1 98 aa0.58□□□□□ -2.32
RNU6-53P-201ENST00000365367 M0QXV9 152 aa0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms