RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa17.22■□□□□ 0.35
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PTPRM-201ENST00000332175 C11orf86A6NJI1 115 aa17.03■□□□□ 0.32
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PTPRM-201ENST00000332175 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.323e-7■■■□□ 18.6
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PTPRM-201ENST00000332175 MED14OSP0DP75 135 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 CTRLP40313 264 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM258P61165 79 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 NOTCH3Q9UM47 2321 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0B4J2C4 111 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 LGALS9O00182 355 aa17.01■□□□□ 0.31
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