RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 AVPP01185 164 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 PRO0461Q9UI25 63 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0J9YX75 114 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHB2Q96CS7 222 aa16.78■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 A0A087WWL8 130 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 H3BMG7 143 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 WFDC2Q14508 124 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 ITPR1Q14643 2758 aa16.77■□□□□ 0.28
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 SCGB1D4Q6XE38 83 aa16.77■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 K7EQG2 157 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF876PQ49A33 203 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 SYT8Q8NBV8 401 aa16.76■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 F5H697 171 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 RPL39P62891 51 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 RNF152Q8N8N0 203 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 RHOHQ15669 191 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE13Q4V321 117 aa16.75■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0J9YY99 117 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 M0QY20 66 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF688P0C7X2 276 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa16.74■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 AMTNQ6UX39 209 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 J3QR89 54 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 DSCR9P59020 149 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 MDFICQ9P1T7 246 aa16.73■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 NFE4Q86UQ8 179 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 Q8N1Y9 231 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.72■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV4-59P01825 116 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 EPG5Q9HCE0 2579 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 ZFHX3Q15911 3703 aa16.71■□□□□ 0.27
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB112Q30KQ8 113 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 PKD1L2Q7Z442 2459 aa16.7■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 EMP1P54849 157 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 FAM74A4Q5TZK3 123 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 AMELXQ99217 191 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 USP24Q9UPU5 2620 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 TSPEAR-AS2P59090 65 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF56Q15929 161 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 TSPAN13O95857 204 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 ETDBQ3ZM63 59 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 SLC25A29Q8N8R3 303 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2D3P61077 147 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2D2P62837 147 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM238C9JI98 176 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM170BQ5T4T1 132 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 EDA2RQ9HAV5 297 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV3-30P01768 117 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 SH2D6Q7Z4S9 175 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFA11Q86Y39 141 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 J3QLI3 93 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 SPINK13Q1W4C9 94 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 LYRM7Q5U5X0 104 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 LINC01356Q8N9X3 169 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA25Q9BR10 227 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 J3QQQ9 107 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 P0DMU3 169 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 FAM231AP0DMU4 169 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 FAM231CP0DMU5 169 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP126Q5VTH2 177 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXD1-201ENST00000331462 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.65■□□□□ 0.263e-6■□□□□ 9.8
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV3-20P01619 116 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 ELANEP08246 267 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 SCGB1A1P11684 91 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 SYNJ2BPP57105 145 aa16.64■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 A0A096LNT2 108 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 I3L3M4 83 aa16.63■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM223A0PJW6 202 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 GAGE12HA6NDE8 117 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 LEPROTO15243 131 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 SIGMAR1Q99720 223 aa16.62■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 A8MTW9 85 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 MTURNQ8N3F0 131 aa16.6■□□□□ 0.25
HOXD1-201ENST00000331462 UBE2E2Q96LR5 201 aa16.6■□□□□ 0.25
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