RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 IGLC1P0CG04 106 aa7.35□□□□□ -1.23
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CUX1-201ENST00000292535 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.34□□□□□ -1.23
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CUX1-201ENST00000292535 A4D1N5 150 aa7.29□□□□□ -1.24
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CUX1-201ENST00000292535 DKK2Q9UBU2 259 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-201ENST00000292535 IGKV4-1P06312 121 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-201ENST00000292535 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-201ENST00000292535 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CUX1-201ENST00000292535 GPHB5Q86YW7 130 aa7.27□□□□□ -1.25
CUX1-201ENST00000292535 CFAP46Q8IYW2 2715 aa7.27□□□□□ -1.25
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