RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ZNF815PA8K554 130 aa20.88■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 PMVKQ15126 192 aa20.88■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 C9orf85Q96MD7 179 aa20.88■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 TIMM17AQ99595 171 aa20.88■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 JPT2Q9H910 190 aa20.88■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa20.87■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 TSHBP01222 138 aa20.87■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 MYO18BQ8IUG5 2567 aa20.87■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 RIPPLY3P57055 190 aa20.87■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 HERVK_113P61574 105 aa20.87■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 TMEM95Q3KNT9 176 aa20.87■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa20.86■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa20.86■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 F5H697 171 aa20.86■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 A0A087WWL8 130 aa20.85■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa20.85■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa20.85■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 A6NJY4 79 aa20.85■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 SYT8Q8NBV8 401 aa20.85■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 A0A0J9YX75 114 aa20.85■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 SDHAF1A6NFY7 115 aa20.85■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 RPL24P83731 157 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 C11orf86A6NJI1 115 aa20.84■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 ZNF688P0C7X2 276 aa20.84■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 SCGB1D4Q6XE38 83 aa20.84■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 WFDC12Q8WWY7 111 aa20.84■□□□□ 0.93
UBP1-201ENST00000283628 A0A096LNT2 108 aa20.82■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa20.82■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 K7EQG2 157 aa20.82■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 IGHV4-59P01825 116 aa20.82■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 DEFB112Q30KQ8 113 aa20.81■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 RPL39P62891 51 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 SPG11Q96JI7 2443 aa20.8■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 VPS13CQ709C8 3753 aa20.79■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 H3BMG7 143 aa20.79■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHB2Q96CS7 222 aa20.79■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa20.78■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 FAM74A4Q5TZK3 123 aa20.78■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 MDFICQ9P1T7 246 aa20.78■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 M0QY20 66 aa20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 RHOHQ15669 191 aa20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 ZNF876PQ49A33 203 aa20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 Q8N1Y9 231 aa20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 UBE2D1P51668 147 aa20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 LINC01356Q8N9X3 169 aa20.77■□□□□ 0.92
UBP1-201ENST00000283628 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 WFDC2Q14508 124 aa20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 ZNF56Q15929 161 aa20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 C10orf99Q6UWK7 81 aa20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 GAGE13Q4V321 117 aa20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 RNF152Q8N8N0 203 aa20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa20.76■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 J3QLI3 93 aa20.75■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa20.75■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 IGKV3-20P01619 116 aa20.74■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 J3QR89 54 aa20.74■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 A0A0J9YY99 117 aa20.73■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 EMP1P54849 157 aa20.73■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP20.73■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 31.9
UBP1-201ENST00000283628 SPINK13Q1W4C9 94 aa20.73■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 AMTNQ6UX39 209 aa20.73■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 PRO0461Q9UI25 63 aa20.72■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 SYNJ2BPP57105 145 aa20.71■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-9P60411 292 aa20.71■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 TMEM170BQ5T4T1 132 aa20.71■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 NFE4Q86UQ8 179 aa20.71■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 ZNRF2Q8NHG8 242 aa20.71■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 ELANEP08246 267 aa20.71■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa20.71■□□□□ 0.91
UBP1-201ENST00000283628 TRGV11A0A075B6L2 103 aa20.7■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 FBN2P35556 2912 aa20.69■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa20.69■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 FAM208BQ5VWN6 2430 aa20.69■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A29Q8N8R3 303 aa20.68■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 VPREB3Q9UKI3 123 aa20.68■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 TSPEAR-AS2P59090 65 aa20.67■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 UBE2E2Q96LR5 201 aa20.67■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.67■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 I3L3M4 83 aa20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 LRRK2Q5S007 2527 aa20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 J3QQQ9 107 aa20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 ETDBQ3ZM63 59 aa20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 LYRM7Q5U5X0 104 aa20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 C20orf203Q8NBC4 194 aa20.66■□□□□ 0.9
UBP1-201ENST00000283628 TSPAN13O95857 204 aa20.65■□□□□ 0.9
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