RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 HAMPP81172 84 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MLST8Q9BVC4 326 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 K7EQG2 157 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 SPRY2O43597 315 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ETDBQ3ZM63 59 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 PRR31Q5SQ13 230 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 BLCAPP62952 87 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 RS1O15537 224 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MBD6Q96DN6 1003 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 Q8N6K4 173 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 PCP2Q8IVA1 136 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0J9YXV3 536 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 IGLV2-8P01709 118 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 PRAC2D3DTV9 90 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MIFP14174 115 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 K7ERJ3 54 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MP68P56378 58 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 AMTNQ6UX39 209 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 F8W735 103 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 Q6ZQT7 251 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 A0A0J9YY99 117 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 B9D2Q9BPU9 175 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 SPAG11BQ08648 103 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 MSMPQ1L6U9 139 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 hADV29S1A0JD25 119 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 COX7BP24311 80 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB136Q30KP8 78 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 SPATA25Q9BR10 227 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRB-201ENST00000261266 P0DMU3 169 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 FAM231AP0DMU4 169 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 FAM231CP0DMU5 169 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 F8WDY8 70 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 NDUFA7O95182 113 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 C5orf38Q86SI9 138 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 HILS1P60008 231 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM223A0PJW6 202 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 NREPQ16612 68 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 TAX1BP3O14907 124 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 FOXI1Q12951 378 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 MAJINQ3KP22 176 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 NFE4Q86UQ8 179 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1B0GX51 115 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 E7EUB6 86 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 LINC00643Q86TS7 51 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 UBE2AP49459 152 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 PSMB8P28062 276 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 NOTCH4Q99466 2003 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 PTH2Q96A98 100 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-201ENST00000261266 NUPR1O60356 82 aa6.8□□□□□ -1.32
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