RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 U3KQE9 123 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 MLST8Q9BVC4 326 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 WDR81Q562E7 1941 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 MED14OSP0DP75 135 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 INSL3P51460 131 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 DOCK7Q96N67 2140 aa12.4□□□□□ -0.42
CTIF-201ENST00000256413 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 A0A0J9YXY3 114 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 NLRC5Q86WI3 1866 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 NFE4Q86UQ8 179 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.39□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 BUB3O43684 328 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 UFSP1Q6NVU6 142 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 TEX22C9J3V5 150 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 F5H768 121 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 CTSGP08311 255 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 A0A0J9YY99 117 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 RITA1Q96K30 269 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 ZNF407Q9C0G0 2248 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 J3QLI3 93 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 RLFQ13129 1914 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 LINC01619G3V211 115 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 SERP2Q8N6R1 65 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 CACNA1GO43497 2377 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 LTBP1Q14766 1721 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 LHBP01229 141 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 LINC00694P0DN24 101 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 COX7CP15954 63 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZS92 163 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 SPTSSBQ8NFR3 76 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 NOTCH3Q9UM47 2321 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 RNF223E7ERA6 249 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 CREBBPQ92793 2442 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 TRIAP1O43715 76 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-33P01772 117 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 RNF138Q8WVD3 245 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 Q6Q795 121 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 Q8N976 141 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 CTSZQ9UBR2 303 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 SMIM9A6NGZ8 99 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 E7EUB6 86 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 PDE6GP18545 87 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 H3BUA1 57 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 SPTBN2O15020 2390 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.43
CTIF-201ENST00000256413 IGLV2-23P01705 113 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 OBSL1O75147 1896 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 PLCE1Q9P212 2302 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 LINC00310P59036 64 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 WFDC11Q8NEX6 87 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 NPBQ8NG41 125 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 MDFICQ9P1T7 246 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 CXCL5P42830 114 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 C1orf195Q5TG92 126 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 Q6ZPA2 131 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 MGAMO43451 1857 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 NDUFS5O43920 106 aa12.32□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 U3KQK5 164 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 SPRNQ5BIV9 151 aa12.31□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 IL17DQ8TAD2 202 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 A0A096LPF7 62 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.3□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 ENHOQ6UWT2 76 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 CLPSL1A2RUU4 121 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 USP17L23D6RBM5 183 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 K7EQD1 137 aa12.29□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 HRCT1Q6UXD1 115 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.28□□□□□ -0.44
CTIF-201ENST00000256413 THADAQ6YHU6 1953 aa12.28□□□□□ -0.44
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