RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa13.09□□□□□ -0.31
KCNQ1-201ENST00000155840 PKD1L2Q7Z442 2459 aa13.09□□□□□ -0.31
KCNQ1-201ENST00000155840 KNCNA6PVL3 124 aa13.09□□□□□ -0.31
KCNQ1-201ENST00000155840 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.09□□□□□ -0.31
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPEAR-AS2P59090 65 aa13.08□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.08□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.08□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV2A0A0B4J234 112 aa13.08□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.08□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 MDFICQ9P1T7 246 aa13.08□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 ORMDL2Q53FV1 153 aa13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 NF1P21359 2839 aa13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 Q1RN00 199 aa13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 PSMG4Q5JS54 123 aa13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 NFE4Q86UQ8 179 aa13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 J3QR89 54 aa13.07□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 P0DMU3 169 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM231AP0DMU4 169 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM231CP0DMU5 169 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 F8W1H4 67 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 LMO4P61968 165 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 TOMM6Q96B49 74 aa13.06□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 TSPAN13O95857 204 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 PRSS2P07478 247 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 MXRA5Q9NR99 2828 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A0U1RRA0 63 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB9AP51151 201 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 EBI3Q14213 229 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 SUMO4Q6EEV6 95 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 TSHBP01222 138 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 MT-ATP8P03928 68 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 CRYGDP07320 174 aa13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.04□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 RBAKDNA6NC62 111 aa13.04□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 A8MZ25 164 aa13.04□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV4-39P01824 125 aa13.04□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.03□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 PROK1P58294 105 aa13.03□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 MRAP2Q96G30 205 aa13.03□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 CHD6Q8TD26 2715 aa13.03□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 CKS1BP61024 79 aa13.03□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.02□□□□□ -0.32
KCNQ1-201ENST00000155840 RNF223E7ERA6 249 aa13.02□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 TCL1BO95988 128 aa13.02□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 SPXQ9BT56 116 aa13.02□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 Q9UF83 564 aa13.02□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.02□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 FHL3Q13643 280 aa13.01□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 Q6ZSV7 163 aa13.01□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 SPINK8P0C7L1 97 aa13.01□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 DUX3Q96PT4 197 aa13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 PRO0461Q9UI25 63 aa13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 OOSP1A8MZH6 123 aa13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 PIFOQ8TCI5 191 aa13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 TEX15Q9BXT5 2789 aa13□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A0J9YXV3 536 aa12.99□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 KLRB1Q12918 225 aa12.99□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 FOXI1Q12951 378 aa12.99□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 MTORP42345 2549 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 C9JAW5 83 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 DAND5Q8N907 189 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 PIEZO1Q92508 2521 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 GNLYP22749 145 aa12.98□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 A0A0J9YY99 117 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 A4D1N5 150 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 LINC01546A6NGU7 62 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 CFC1BP0CG36 223 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 CFC1P0CG37 223 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 OVOL1O14753 267 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF876PQ49A33 203 aa12.97□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 SYNJ2BPP57105 145 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 HERVK_113P61574 105 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 DEFB136Q30KP8 78 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 Q8N1Y9 231 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 ATP6V0BQ99437 205 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 U3KQE9 123 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 XGP55808 180 aa12.96□□□□□ -0.33
KCNQ1-201ENST00000155840 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 220.1 ms