RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PRCD	Q00LT1	54 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MALSU1	Q96EH3	234 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	BET1L	Q9NYM9	111 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NAT8	Q9UHE5	227 aa		3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	3.42	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11H12	B2RN74	326 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616		B4DSR2	109 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616		H0YJW9	148 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	CXorf1	O96002	111 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	RBP4	P02753	201 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	AKR1D1	P51857	326 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOB	P62745	196 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf83	Q53S99	150 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM78B	Q5VT40	261 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MIC13	Q5XKP0	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PDPN	Q86YL7	162 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB125	Q8N687	156 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11H1	Q8NG94	326 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR11H2	Q8NH07	326 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4A5	Q8NH83	315 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01006	Q8NI28	216 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ACY3	Q96HD9	319 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8B2	Q96RD0	313 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MGST2	Q99735	147 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MED13L	Q71F56	2210 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ACAN	P16112	2415 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf94	C9JXX5	98 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616		F6UZH7	168 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	PDE6D	O43924	150 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	MT-CO2	P00403	227 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ELOB	Q15370	118 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ADIRF	Q15847	76 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8N7P7	452 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NABP2	Q9BQ15	211 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		3.41	□□□□□ -1.86
EFHC1-223	ENST00000636616	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA1	O95477	2261 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0J9YWU9	116 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616		M0R1W7	72 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV3-11	P01762	117 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00869	P0C866	280 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM236C	P0DP71	79 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF6	P10767	208 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	S100P	P25815	95 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2A	P49459	152 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF137P	P52743	207 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	BATF	Q16520	125 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FA2H	Q7L5A8	372 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX29	Q8N6K0	151 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	BORCS7	Q96B45	105 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.4	□□□□□ -1.87
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms