RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628867.1

SPTAN1-215, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-215	ENST00000628867	OR7C2	O60412	319 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ATP6V0C	P27449	155 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	RHOH	Q15669	191 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	PAXX	Q9BUH6	204 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	OR51M1	Q9H341	326 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ZNF492	Q9P255	531 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ARPC5	O15511	151 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ZNF138	P52744	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ZNF345	Q14585	488 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	PRR9	Q5T870	116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	CIDEA	O60543	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	TAS2R45	P59539	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867		Q6ZQT7	251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867		Q8TAT8	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867		A0A087WWC5	75 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867		A0A087WX48	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	GNRH2	O43555	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ELOB	Q15370	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPTAN1-215	ENST00000628867	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	PGP	A6NDG6	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	BCL2L11	O43521	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	GCHFR	P30047	84 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	SERF2	P84101	59 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867		Q0VG73	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867		Q6ZNX1	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867		A0A1W2PPV4	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	TAAR5	O14804	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	MB	P02144	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	GNG5	P63218	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	GAGE1	Q13065	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	GAGE4	Q13068	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	GAGE5	Q13069	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	CRP	P02741	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867		Q6AWC8	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867		Q8N3U1	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	CXorf1	O96002	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	FHIT	P49789	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	ODF1	Q14990	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-215	ENST00000628867	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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