RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625668.2

LINC02028-223, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 2028, human

TSL 5

Gene LINC02028, Length 646 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC02028-223	ENST00000625668	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	LCE6A	A0A183	80 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	IGLL5	B9A064	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	GCG	P01275	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	HTN3	P15516	51 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	PPT1	P50897	306 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	UBE2G1	P62253	170 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE7	O76087	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	LTA	P01374	205 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	AKR1C3	P42330	323 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TCL1A	P56279	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668		Q6ZTI0	123 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	GNRH2	O43555	120 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	SPINK4	O60575	86 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	IFNA1	P01562	189 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TYMS	P04818	313 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	ATP5G1	P05496	136 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	BCL2	P10415	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.78	□□□□□ -1.64
LINC02028-223	ENST00000625668	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668		F5H768	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	CRIP1	P50238	77 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	TCTA	P57738	103 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	AGRN	O00468	2067 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668		M0R036	132 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	PDE6D	O43924	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	SH2D1A	O60880	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	LY6G6C	O95867	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	SPX	Q9BT56	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	HERC1	Q15751	4861 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	ORM1	P02763	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	ASIP	P42127	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	OR5I1	Q13606	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	ODF1	Q14990	250 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LINC02028-223	ENST00000625668		A0A0J9YY99	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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