RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 SIVA1O15304 175 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 SPRNQ5BIV9 151 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 C20orf78Q9BR46 151 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 IL17DQ8TAD2 202 aa6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.77□□□□□ -1.32
CYFIP1-208ENST00000617928 COX7B2Q8TF08 81 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 F8VRH5 84 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 LYL1P12980 280 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 MYCNOSP40205 109 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 GPHB5Q86YW7 130 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 CEND1Q8N111 149 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 WDR81Q562E7 1941 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 Q0VG73 95 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 GTSF1Q8WW33 167 aa6.77□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPRDP23468 1912 aa6.76□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.76□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFA1O15239 70 aa6.76□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 V9GYV3 84 aa6.76□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 FHL1Q13642 323 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 KLK12Q9UKR0 248 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 K7ERJ3 54 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLL1P15814 213 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 BAALCQ8WXS3 180 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 RITA1Q96K30 269 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 DKK2Q9UBU2 259 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 ABCA1O95477 2261 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 RNF152Q8N8N0 203 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C2orf70A6NJV1 201 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PROP1O75360 226 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF726P1Q15940 193 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.75□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 G3V4G9 280 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 RBAKDNA6NC62 111 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 VWA8A3KMH1 1905 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 LTAP01374 205 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB125Q8N687 156 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.74□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 GTF3C1Q12789 2109 aa6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 B9D2Q9BPU9 175 aa6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 H0Y9J4 135 aa6.73□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHG2P01859 326 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR20EP86478 221 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR20CP86479 221 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR20DP86480 221 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR20BP86481 221 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR20AP86496 221 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 KMT2EQ8IZD2 1858 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 INAFM1C9JVW0 142 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf195Q5TG92 126 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF524Q96C55 264 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 RETNQ9HD89 108 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 MGAMO43451 1857 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GX51 115 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 COX8AP10176 69 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N1Y9 231 aa6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 C9JQL5 133 aa6.71□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.71□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 NREPQ16612 68 aa6.71□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N9W7 124 aa6.71□□□□□ -1.33
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 M0QXV9 152 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.7 ms