RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610369.4

TARDBP-211, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-211ENST00000610369 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.56□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.56□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.56□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 A0A087WTM6 91 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 FAM74A7A6NL05 159 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 A8MWV9 139 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 ASIPP42127 132 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 ZNF726P1Q15940 193 aa6.55□□□□□ -1.36
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TARDBP-211ENST00000610369 STOML3Q8TAV4 291 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 LINC00479Q96M42 142 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 IL36BQ9NZH7 164 aa6.55□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.55□□□□□ -1.36
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TARDBP-211ENST00000610369 ARPC5O15511 151 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 FHITP49789 147 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 UBE2G2P60604 165 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 LELP1Q5T871 98 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.54□□□□□ -1.36
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TARDBP-211ENST00000610369 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 FMC1Q96HJ9 113 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.54□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 PSCAO43653 123 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 UBE2G1P62253 170 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 DNLZQ5SXM8 178 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 SYT8Q8NBV8 401 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.53□□□□□ -1.36
TARDBP-211ENST00000610369 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.53□□□□□ -1.36
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TARDBP-211ENST00000610369 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 B4DEV8 164 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 UMAD1C9J7I0 102 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 G3V3Q6 166 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 RHODO00212 210 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 ZNF345Q14585 488 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 CST9LP1Q5W188 147 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 Q86TA4 180 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 PARLQ9H300 379 aa6.52□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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TARDBP-211ENST00000610369 J3QL48 77 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 SEC11BP0C7V7 166 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 CRIP1P50238 77 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 LAGE3Q14657 143 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 TM2D2Q9BX73 214 aa6.51□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 A0A0D9SG52 128 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 HMSDA8MTL9 139 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 SH2D1AO60880 128 aa6.5□□□□□ -1.37
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TARDBP-211ENST00000610369 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 Q6ZSN1 163 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 RYR1P21817 5038 aa6.5□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 GAGE12JA6NER3 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 H3BVH4 76 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 M0R036 132 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 PAGE4O60829 102 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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TARDBP-211ENST00000610369 AKR1C3P42330 323 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 GAGE1Q13065 139 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 GAGE4Q13068 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 GAGE5Q13069 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 GAGE13Q4V321 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 TOR2AQ5JU69 321 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 SFRP2Q96HF1 295 aa6.49□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 EPM2AB3EWF7 344 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 IGHV3-30P01768 117 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 IGHV3-33P01772 117 aa6.48□□□□□ -1.37
TARDBP-211ENST00000610369 LINC00694P0DN24 101 aa6.48□□□□□ -1.37
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