RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPDPFLQ8WWR9 84 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLAC4Q8WY50 150 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAFIPQ8WZ33 124 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATG5Q9H1Y0 275 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYH13Q9UKX3 1938 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PHLPP1O60346 1717 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYH6P13533 1939 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 YPEL1O60688 119 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00208Q96KT6 92 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMIM3Q9BZL3 60 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 COPZ2Q9P299 210 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NINQ8N4C6 2090 aa0.33□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 APCP25054 2843 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 J3QLW9 94 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PITX3O75364 302 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LY6G6CO95867 125 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00694P0DN24 101 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPINT3P49223 89 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPL37P61927 97 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NCS1P62166 190 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 S100A12P80511 92 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMCO1Q147U7 214 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 IQCJQ1A5X6 159 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPINK9Q5DT21 86 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MMGT1Q8N4V1 131 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 DYNLRB2Q8TF09 96 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LZICQ8WZA0 190 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 GRIN2AQ12879 1464 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM2Q9UHN6 1383 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPTBP11277 2137 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ESPL1Q14674 2120 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MUC5ACP98088 5654 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 A0A096LNT2 108 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRAV17A0A0B4J275 112 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCKP06307 115 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC25A6P12236 298 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF137PP52743 207 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 KLKP1Q107X0 134 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF56Q15929 161 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR2T2Q6IF00 324 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NDUFA11Q86Y39 141 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CTAGE3PQ8IX95 158 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TPT1P8Q9HAU6 139 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NRXN2Q9P2S2 1712 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 BCL9LQ86UU0 1499 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LOC285556D6RIA3 1793 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FOCADQ5VW36 1801 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PHIPQ8WWQ0 1821 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC179H3BU77 68 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 M0R129 80 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 M0R2Z0 102 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FXYD1O00168 92 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NPFFO15130 113 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 COX4I1P13073 169 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FXYD6P3P58550 94 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ARPC4P59998 168 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 RPS25P62851 125 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPINK13Q1W4C9 94 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 C6orf52Q5T4I8 152 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC01545Q5VT33 79 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q6ZUT4 128 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TSTD1Q8NFU3 115 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 VSTM2AQ8TAG5 236 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 VPS25Q9BRG1 176 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SAR1AQ9NR31 198 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ERG28Q9UKR5 140 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TANC1Q9C0D5 1861 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 A0A087WTM6 91 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TFF1P04155 84 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PYYP10082 97 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NPC2P61916 151 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 EMX2Q04743 252 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 MIC13Q5XKP0 118 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SDF2Q99470 211 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PFDN5Q99471 154 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM14BQ9NUH8 114 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPEF2Q9C093 1822 aa0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms