RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 FOXF2Q12947 444 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 C20orf173Q96LM9 149 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRY3O43610 288 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 COX6B1P14854 86 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 PLGLAQ15195 96 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZT83 130 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 USF3Q68DE3 2245 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 EDN2P20800 178 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 Q5XG85 94 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 PRCDQ00LT1 54 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 LAGE3Q14657 143 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 MORN5Q5VZ52 161 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 SMKR1H3BMG3 65 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 RELNP78509 3460 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 PSPNO60542 156 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 CCL8P80075 99 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 COL8A2P25067 703 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR86Q86TI4 376 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 METTL26Q96S19 204 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 DSCR8Q96T75 97 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 H7C2G1 150 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 J3QQQ9 107 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC25A16P16260 332 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM86BQ8N661 226 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-218ENST00000590367 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFC2O95298 119 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 PLAUP00749 431 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 COPS9Q8WXC6 57 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 C9orf85Q96MD7 179 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0B4J2C4 111 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-33P01772 117 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 NPC2P61916 151 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 PLCE1Q9P212 2302 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF785A8K8V0 405 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00205P59089 165 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 SERP2Q8N6R1 65 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 MTORP42345 2549 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 LOXL3P58215 753 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM201AQ5SY85 155 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 PATE2Q6UY27 113 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 PRIMA1Q86XR5 153 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNRF1Q8ND25 227 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 TEX15Q9BXT5 2789 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 LEAP2Q969E1 77 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM19A4Q96LR4 140 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0J9YY99 117 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-30P01768 117 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM236CP0DP71 79 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNJ2BPP57105 145 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF152Q8N8N0 203 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 PEMTQ9UBM1 199 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 ITPR2Q14571 2701 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 UPK2O00526 184 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 THAP8Q8NA92 274 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 C2orf48Q96LS8 159 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 SIRPDQ9H106 197 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0G2JNJ9 132 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.2 ms