RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	RTL8C	O15255	209 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	RS1	O15537	224 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	NACA	E9PAV3	2078 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	MUC4	Q99102	2169 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	CIDEA	O60543	219 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	GYPE	P15421	78 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	DNAH2	Q9P225	4427 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PSME3-209	ENST00000589469	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469		K7EQD1	137 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	IFNA1	P01562	189 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	SRI	P30626	198 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	BAGE2	Q86Y30	109 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469		H3BVH4	76 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	C11orf52	Q96A22	123 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1B0GVG6	124 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	MLST8	Q9BVC4	326 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469		A8MWV9	139 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	NXPH4	O95158	308 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	C6orf223	Q8N319	242 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	PDE6D	O43924	150 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	BCL2	P10415	239 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	RHOH	Q15669	191 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	DERL1	Q9BUN8	251 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	PARL	Q9H300	379 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	HERC2	O95714	4834 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PSME3-209	ENST00000589469	SIVA1	O15304	175 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	PRR27	Q6MZM9	219 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	CENPW	Q5EE01	88 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF575	Q86XF7	245 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	VAX2	Q9UIW0	290 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	CXCL1	P09341	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1B0GVY2	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469		M0R381	172 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	MED14OS	P0DP75	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	BLOC1S1	P78537	153 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	JPT2	Q9H910	190 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	MED9	Q9NWA0	146 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	RHOD	O00212	210 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	GNG4	P50150	75 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	SMIM12	Q96EX1	92 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	RAB19	A4D1S5	217 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	IGLV2-8	P01709	118 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	TIRAP	P58753	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469	SFRP2	Q96HF1	295 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PSME3-209	ENST00000589469		Q6ZSN1	163 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469		A0A087WWL8	130 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	TNP2	Q05952	138 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	SNAI2	O43623	268 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PSME3-209	ENST00000589469	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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