RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.55□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.55□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 K7EN84 100 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 GCGP01275 180 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 CT45A10P0DMU9 189 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 HLA-DRB4P13762 266 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 FXYD7P58549 80 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 DAD1P61803 113 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.54□□□□□ -1.2
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TOP3A-210ENST00000580713 C8orf49Q96NF6 230 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 MLST8Q9BVC4 326 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 BIN3Q9NQY0 253 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.54□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 B4DEV8 164 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 NUDT3O95989 172 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 IGKV3-20P01619 116 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 OR5I1Q13606 314 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 SMUG1Q53HV7 270 aa7.53□□□□□ -1.2
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TOP3A-210ENST00000580713 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 ISOC2Q96AB3 205 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 ODF3Q96PU9 254 aa7.53□□□□□ -1.2
TOP3A-210ENST00000580713 A8MTW9 85 aa7.52□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 LEPP41159 167 aa7.52□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 CCL18P55774 89 aa7.52□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 RHEBQ15382 184 aa7.52□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.52□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.52□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.52□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 MT-ND4LP03901 98 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 GPX1P07203 203 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 CRISP2P16562 243 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 TSPOP30536 169 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 ERVFC1-1P60608 527 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 SFRP2Q96HF1 295 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 OSTCQ9NRP0 149 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.51□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 MYCBP2O75592 4640 aa7.5□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 J3KRW8 73 aa7.5□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.5□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 PRR9Q5T870 116 aa7.5□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 AMTNQ6UX39 209 aa7.5□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.5□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 A0A087WWC5 75 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.49□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 KLLNB2CW77 178 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 F5H768 121 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 M0R2Z0 102 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 PPP1R2P9O14990 202 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 SH2D1AO60880 128 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 P01737 135 aa7.49□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 CRIP1P50238 77 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 XGP55808 180 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 RRN3P1Q2M238 152 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 TTC32Q5I0X7 151 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 NUDT11Q96G61 164 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 Q9H8V8 135 aa7.49□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.49□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.48□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 C7orf71A4D174 169 aa7.48□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 H7BYZ3 331 aa7.48□□□□□ -1.21
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TOP3A-210ENST00000580713 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 BTN1A1Q13410 526 aa7.48□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 KIR3DS1Q14943 382 aa7.48□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 Q6AWC8 147 aa7.48□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 SCO1O75880 301 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 DEFB130BP0DP73 79 aa7.47□□□□□ -1.21
TOP3A-210ENST00000580713 DEFB130AP0DP74 79 aa7.47□□□□□ -1.21
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