RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 SRIP30626 198 aa8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 BAGE2Q86Y30 109 aa8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 UPK3BQ9BT76 320 aa8.56□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 K7EQD1 137 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 RTL8CO15255 209 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 RS1O15537 224 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 IL36BQ9NZH7 164 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 MUC4Q99102 2169 aa8.55□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFNA1P01562 189 aa8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTC32Q5I0X7 151 aa8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.54□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 A8MWV9 139 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 H3BVH4 76 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 LINC01559Q495D7 138 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNLZQ5SXM8 178 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 SYT8Q8NBV8 401 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 C11orf52Q96A22 123 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.53□□□□□ -1.04
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1B0GVG6 124 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDE6DO43924 150 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 NXPH4O95158 308 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 C6orf223Q8N319 242 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MLST8Q9BVC4 326 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.52□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1W2PPQ1 181 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SIVA1O15304 175 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 BCL2P10415 239 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 RHOHQ15669 191 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRR27Q6MZM9 219 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 PARLQ9H300 379 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 VAX2Q9UIW0 290 aa8.51□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 NACAE9PAV3 2078 aa8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 BLOC1S1P78537 153 aa8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 DERL1Q9BUN8 251 aa8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MED9Q9NWA0 146 aa8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.5□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 M0R381 172 aa8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 RHODO00212 210 aa8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNG4P50150 75 aa8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CENPWQ5EE01 88 aa8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF575Q86XF7 245 aa8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZFP82Q8N141 532 aa8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 JPT2Q9H910 190 aa8.49□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A1B0GVY2 172 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAB19A4D1S5 217 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 CXCL1P09341 107 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 MED14OSP0DP75 135 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 TIRAPP58753 221 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.48□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.47□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 Q6ZSN1 163 aa8.47□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMIM12Q96EX1 92 aa8.47□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 SFRP2Q96HF1 295 aa8.47□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 BIN3Q9NQY0 253 aa8.47□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.47□□□□□ -1.05
USP3-AS1-205ENST00000560067 A0A087WWL8 130 aa8.46□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 EVI2AP22794 236 aa8.46□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNP2Q05952 138 aa8.46□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.46□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.46□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.45□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAGE12JA6NER3 117 aa8.45□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.45□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGLV2-8P01709 118 aa8.45□□□□□ -1.06
USP3-AS1-205ENST00000560067 OR5AL1P0C617 328 aa8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms