RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	HTN1	P15515	57 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	CBY3	A6NI87	242 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV2-8	P01709	118 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	CRIP1	P50238	77 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TWIST1	Q15672	202 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312		Q6ZQT7	251 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF727	A8MUV8	499 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SNURFL	B1AK76	121 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	RHOD	O00212	210 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	AZU1	P20160	251 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	CEBPG	P53567	150 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF415	Q09FC8	603 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	MUC21	Q5SSG8	566 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	NRAC	Q8N912	160 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	NAGK	Q9UJ70	344 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	CXorf65	A6NEN9	183 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312		B4DEV8	164 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312		C9JQL5	133 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	DEFB4A	O15263	64 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SH2D1A	O60880	128 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ORM1	P02763	201 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	PRM2	P04554	102 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TCL1A	P56279	114 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	PRR27	Q6MZM9	219 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SPX	Q9BT56	116 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00862	A6NCI5	91 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TYMS	P04818	313 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	CXCL1	P09341	107 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	EMP1	P54849	157 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFA5	Q16718	116 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01551	Q86U37	167 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	NAT8	Q9UHE5	227 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	XKRY2	A2RUG3	117 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312		K7EN84	100 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312		M0R036	132 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	GNRH2	O43555	120 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312		P01737	135 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	SFTA3	P0C7M3	94 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	ASIP	P42127	132 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	OR5I1	Q13606	314 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	IL36B	Q9NZH7	164 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	CELA1	Q9UNI1	258 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312		M0R2P5	195 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	SPINK4	O60575	86 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	DAD1	P61803	113 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	COMMD7	Q86VX2	200 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	RASL10A	Q92737	203 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	PTH2	Q96A98	100 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM218	A2RU14	115 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NUMB-231	ENST00000559312	OR5AL1	P0C617	328 aa		5.31	□□□□□ -1.56

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