RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 WFDC1Q9HC57 220 aa5.48□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 RS1O15537 224 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 GNG5P63218 68 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 RHOHQ15669 191 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 LELP1Q5T871 98 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 CFAP126Q5VTH2 177 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 RAB24Q969Q5 203 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PTH2Q96A98 100 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 TM2D2Q9BX73 214 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 GTSF1LQ9H1H1 148 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 Q9HAA7 133 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 PSG8Q9UQ74 426 aa5.47□□□□□ -1.53
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GCGP01275 180 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-30P01768 117 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-33P01772 117 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 MBP02144 154 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 TCRAP04437 139 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 MGST1P10620 155 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GCHFRP30047 84 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ZFP69Q49AA0 526 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 SMUG1Q53HV7 270 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 Q8N814 137 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 EPDR1Q9UM22 224 aa5.46□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 CXorf1O96002 111 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 STAG3L2P0CL84 134 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 STAG3L3P0CL85 134 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 SERF2P84101 59 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 PRNTQ86SH4 94 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 SUN5Q8TC36 379 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 C9orf85Q96MD7 179 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.45□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 A8MWV9 139 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 IGLV2-11P01706 119 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 C1QBP02746 253 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 LAGE3Q14657 143 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 Q6ZSN1 163 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 A0A087WWC5 75 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PRE2 83 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GAGE12JA6NER3 117 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GGTLC3B5MD39 225 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ATP6V0CP27449 155 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ASIPP42127 132 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 HAMPP81172 84 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GAGE1Q13065 139 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GAGE4Q13068 117 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GAGE5Q13069 117 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 GAGE13Q4V321 117 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 TOR2AQ5JU69 321 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 COX11Q9Y6N1 276 aa5.43□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 IFNA7P01567 189 aa5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 LINC00479Q96M42 142 aa5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 AQP10Q96PS8 301 aa5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 PARLQ9H300 379 aa5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 ALG5Q9Y673 324 aa5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 HERC1Q15751 4861 aa5.41□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa5.41□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.41□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.41□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 B4DEV8 164 aa5.41□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 SEC11BP0C7V7 166 aa5.41□□□□□ -1.54
COCH-211ENST00000557065 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms