RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A8MWV9 139 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PEX7O00628 323 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RS1O15537 224 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGLV2-11P01706 119 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PTH2Q96A98 100 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.3□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RYR1P21817 5038 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A0A087WTM6 91 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARPC5O15511 151 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UBE2G1P62253 170 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 Q8N1X5 172 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SYT8Q8NBV8 401 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LINC00479Q96M42 142 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C9orf85Q96MD7 179 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 B4DEV8 164 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CST9LP1Q5W188 147 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM74A7A6NL05 159 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LELP1Q5T871 98 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FMC1Q96HJ9 113 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF726P1Q15940 193 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 Q86TA4 180 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 Q9HAA7 133 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A0A087WWC5 75 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 H3BVH4 76 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 M0R036 132 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RHODO00212 210 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGHV3-30P01768 117 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGHV3-33P01772 117 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TM2D2Q9BX73 214 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IL36BQ9NZH7 164 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GAGE12JA6NER3 117 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EPM2AB3EWF7 344 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GCSHP23434 173 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GAGE1Q13065 139 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GAGE4Q13068 117 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GAGE5Q13069 117 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GAGE13Q4V321 117 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TOR2AQ5JU69 321 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PARLQ9H300 379 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HSPG2P98160 4391 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UMAD1C9J7I0 102 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PFDN1O60925 122 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AKR1C3P42330 323 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FHITP49789 147 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SH2D1AO60880 128 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SEC11BP0C7V7 166 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LAGE3Q14657 143 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 M0R381 172 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF345Q14585 488 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZFP82Q8N141 532 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FAM213BQ8TBF2 198 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FRZBQ92765 325 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.21□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A0A0D9SG52 128 aa9.2□□□□□ -0.94
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PAGE4O60829 102 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms