RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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CS-231ENST00000552222 LYRM9A8MSI8 78 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SH2D1AO60880 128 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SMIM12Q96EX1 92 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 KCNS1Q96KK3 526 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 PARLQ9H300 379 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 MDFICQ9P1T7 246 aa9.67□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TRGV11A0A075B6L2 103 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 GNRH2O43555 120 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 IGLV2-8P01709 118 aa9.66□□□□□ -0.86
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CS-231ENST00000552222 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
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CS-231ENST00000552222 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.66□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SNURFLB1AK76 121 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 C9JCJ5 164 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 TCL1AP56279 114 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 SEC11CQ9BY50 192 aa9.65□□□□□ -0.86
CS-231ENST00000552222 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 C9JQL5 133 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 TYMSP04818 313 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 SFTA3P0C7M3 94 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 ADCYAP1P18509 176 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 CEBPGP53567 150 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 ZNF415Q09FC8 603 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 C6orf223Q8N319 242 aa9.64□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 B4DEV8 164 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 ORM1P02763 201 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 Q5VSD8 79 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 PRR27Q6MZM9 219 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 C18orf15Q96N68 181 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 F8W036 122 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 SPINK4O60575 86 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 DEFB130BP0DP73 79 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 DEFB130AP0DP74 79 aa9.62□□□□□ -0.87
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CS-231ENST00000552222 XGP55808 180 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 DAD1P61803 113 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 LINC01559Q495D7 138 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 SPXQ9BT56 116 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 K7EN84 100 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 M0R036 132 aa9.61□□□□□ -0.87
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CS-231ENST00000552222 RNF212Q495C1 297 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 DNLZQ5SXM8 178 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 Q6ZTI0 123 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 SVBPQ8N300 66 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 OCC1Q8TAD7 63 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 BIN3Q9NQY0 253 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 GAGE12BA1L429 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 ZNF727A8MUV8 499 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 GAGE7O76087 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 GAGE12FP0CL80 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 GAGE12GP0CL81 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 GAGE12IP0CL82 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 ASIPP42127 132 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 HAMPP81172 84 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 OR5I1Q13606 314 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 C9orf85Q96MD7 179 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 RPL19P84098 196 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-231ENST00000552222 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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CS-231ENST00000552222 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 M0R2P5 195 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 CXCL1P09341 107 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 LINC01551Q86U37 167 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 RASL10AQ92737 203 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 PTH2Q96A98 100 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 IL36BQ9NZH7 164 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 SNAPINO95295 136 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-231ENST00000552222 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.57□□□□□ -0.88
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