RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552009.1

GNPTAB-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-209ENST00000552009 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 HMSDA8MTL9 139 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 H3BNG1 76 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF253O75346 499 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 S100A11P31949 105 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 CRYBA4P53673 196 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 RANP62826 216 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF415Q09FC8 603 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.63□□□□□ -1.67
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GNPTAB-209ENST00000552009 STX12Q86Y82 276 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 FAM210AQ96ND0 272 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 RNF24Q9Y225 148 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 HSPB11Q9Y547 144 aa4.63□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 MYCBP2O75592 4640 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 K7EQD1 137 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 IFNA7P01567 189 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 CRISP2P16562 243 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF138P52744 262 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF345Q14585 488 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 C18orf15Q96N68 181 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 PAXXQ9BUH6 204 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF492Q9P255 531 aa4.62□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 F6UZH7 168 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 GNRH2O43555 120 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 OR7C2O60412 319 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ATP6V1G1O75348 118 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 SRIP30626 198 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 HBG1P69891 147 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 HBG2P69892 147 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 PDE6HQ13956 83 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF876PQ49A33 203 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
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GNPTAB-209ENST00000552009 NMES1Q9C002 83 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 OR51M1Q9H341 326 aa4.61□□□□□ -1.67
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GNPTAB-209ENST00000552009 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.61□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.6□□□□□ -1.67
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GNPTAB-209ENST00000552009 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 S100A1P23297 94 aa4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 H2BFSP57053 126 aa4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 GNG5P63218 68 aa4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ATP6V1FQ16864 119 aa4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 Q9HAA7 133 aa4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.59□□□□□ -1.67
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GNPTAB-209ENST00000552009 G3V3Q6 166 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 CRYGDP07320 174 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 RAB14P61106 215 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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GNPTAB-209ENST00000552009 GAGE6Q13070 117 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 ZNF266Q14584 549 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 FFAR4Q5NUL3 377 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 SLC51BQ86UW2 128 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 TVP23CQ96ET8 276 aa4.59□□□□□ -1.67
GNPTAB-209ENST00000552009 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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GNPTAB-209ENST00000552009 C9JCJ5 164 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 SMLR1H3BR10 107 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 ARPC5O15511 151 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 BCL2L11O43521 198 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 IFNA5P01569 189 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 IGHV3-30P01768 117 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 IGHV3-33P01772 117 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 TYMSP04818 313 aa4.58□□□□□ -1.68
GNPTAB-209ENST00000552009 NMBP08949 121 aa4.58□□□□□ -1.68
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