RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	GCHFR	P30047	84 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDX11-222	ENST00000542777	GNG5	P63218	68 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SLC51B	Q86UW2	128 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DDX11-222	ENST00000542777	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
DDX11-222	ENST00000542777	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDX11-222	ENST00000542777	SGK494	Q96LW2	274 aa		10.78	□□□□□ -0.68
DDX11-222	ENST00000542777	HERC1	Q15751	4861 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF876P	Q49A33	203 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SUN5	Q8TC36	379 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.77	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1B0GV50	99 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	RS1	O15537	224 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CIDEA	O60543	219 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		10.76	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	HAMP	P81172	84 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	RHOH	Q15669	191 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777		Q9HAA7	133 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		10.75	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	FAM229A	H3BQW9	127 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CXorf1	O96002	111 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-30	P01768	117 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-33	P01772	117 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SULT1A2	P50226	295 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		10.74	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777		K7EQM0	130 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	GCG	P01275	180 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TCRA	P04437	139 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	UBE2G2	P60604	165 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	CCL20	P78556	96 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	LELP1	Q5T871	98 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777		Q8N814	137 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	C9orf85	Q96MD7	179 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	PSG8	Q9UQ74	426 aa		10.73	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	PTH2	Q96A98	100 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		10.72	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		10.71	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	SMUG1	Q53HV7	270 aa		10.71	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	PRNT	Q86SH4	94 aa		10.71	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.71	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
DDX11-222	ENST00000542777	IGLV2-11	P01706	119 aa		10.7	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.7	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	FAM74A7	A6NL05	159 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZSN1	163 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	TM2D2	Q9BX73	214 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		10.69	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	LAGE3	Q14657	143 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.68	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777		A0A1W2PRE2	83 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	PAGE4	O60829	102 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	RAB5C	P51148	216 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	PARL	Q9H300	379 aa		10.67	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE12J	A6NER3	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777		A8MWV9	139 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE1	Q13065	139 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE4	Q13068	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE5	Q13069	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	GAGE13	Q4V321	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
DDX11-222	ENST00000542777	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		10.66	□□□□□ -0.7

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