RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 FHL3Q13643 280 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 PSG8Q9UQ74 426 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 SOCS3O14543 225 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 GCSHP23434 173 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 SFTA2Q6UW10 78 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 K7ERJ3 54 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 FCER1GP30273 86 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 C18orf15Q96N68 181 aa6.55□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 KIR3DS1Q14943 382 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 VGLL1Q99990 258 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 ST20Q9HBF5 79 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 AZU1P20160 251 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 C20orf173Q96LM9 149 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 SORL1Q92673 2214 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 P01737 135 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 KRTAP10-3P60369 221 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 HBBP68871 147 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 DCANP1Q8TF63 244 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.54□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 RBAKDNA6NC62 111 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 ID1P41134 155 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 ERCC8Q13216 396 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 FA2HQ7L5A8 372 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.53□□□□□ -1.36
THBS3-210ENST00000541576 OVOL1O14753 267 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 CACNG7P62955 275 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 PCP2Q8IVA1 136 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 Q8TAT8 98 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 CRIP1P50238 77 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 DEFB1P60022 68 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 C8orf49Q96NF6 230 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 PRR25Q96S07 402 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 COX19Q49B96 90 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 AMTNQ6UX39 209 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 ZNF492Q9P255 531 aa6.52□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 A8MWL6 223 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 K7EQG2 157 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 CT45A10P0DMU9 189 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 GTSF1Q8WW33 167 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 AGRNO00468 2067 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 G3V4G9 280 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.51□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 A6NDN8 102 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 SMKR1H3BMG3 65 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 ZNF688P0C7X2 276 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 PSMG4Q5JS54 123 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 F6UB75 175 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 FABP2P12104 132 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.5□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 ETDBQ3ZM63 59 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 LINC00477Q96M19 166 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 C9orf118A6NHY6 69 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 PF4P02776 101 aa6.49□□□□□ -1.37
THBS3-210ENST00000541576 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.49□□□□□ -1.37
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