RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FAM74A7A6NL05 159 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 K7EP13 123 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 RS1O15537 224 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 CDK2AP2O75956 126 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 KRTAP10-2P60368 255 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ERVFC1-1P60608 527 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 UBE2G1P62253 170 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 CST9LP1Q5W188 147 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 C9orf85Q96MD7 179 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FAT1Q14517 4588 aa6.13□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 B4DEV8 164 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 G3V3Q6 166 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 CRYGDP07320 174 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ASIPP42127 132 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 RHOHQ15669 191 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.12□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 A8MWV9 139 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 M0R036 132 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FHITP49789 147 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 LINC01559Q495D7 138 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 Q86TA4 180 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 PTH2Q96A98 100 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FMC1Q96HJ9 113 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.11□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 A0A0D9SG52 128 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 A0A1B0GV50 99 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 GRIFINA4D1Z8 144 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 H3BVH4 76 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 PSCAO43653 123 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 PAGE4O60829 102 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-30P01768 117 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-33P01772 117 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 CRIP1P50238 77 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 SYT8Q8NBV8 401 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.1□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 A0A087WTM6 91 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 GAGE12JA6NER3 117 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 HMSDA8MTL9 139 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 UMAD1C9J7I0 102 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 SH2D1AO60880 128 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ARMS2P0C7Q2 107 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 SEC11BP0C7V7 166 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 AKR1C3P42330 323 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 TIRAPP58753 221 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 GAGE1Q13065 139 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 GAGE4Q13068 117 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 GAGE5Q13069 117 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ZNF345Q14585 488 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 GAGE13Q4V321 117 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 LELP1Q5T871 98 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 PARLQ9H300 379 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 JPT2Q9H910 190 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 IL36BQ9NZH7 164 aa6.09□□□□□ -1.43
LMO3-222ENST00000540445 M0R381 172 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 PFDN1O60925 122 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 Q6ZSN1 163 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 OR11H4Q8NGC9 324 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 Q9HAA7 133 aa6.08□□□□□ -1.44
LMO3-222ENST00000540445 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.08□□□□□ -1.44
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