RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527052.5

NOD2-204, Transcript of nucleotide binding oligomerization domain containing 2, human

TSL 1 (best)

Gene NOD2, Length 338 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOD2-204	ENST00000527052	BCL2	P10415	239 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	UBE2G2	P60604	165 aa		10.07	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	EPDR1	Q9UM22	224 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		10.06	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052		C9JCJ5	164 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052		K7EQD1	137 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	SFTA3	P0C7M3	94 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	GYPE	P15421	78 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	NAGK	Q9UJ70	344 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		10.05	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052		M0R2P5	195 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	TCRA	P04437	139 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	EVI2A	P22794	236 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	PEA15	Q15121	130 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	KCNS1	Q96KK3	526 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	FAM210A	Q96ND0	272 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.04	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	PEX7	O00628	323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	UBE2G1	P62253	170 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	CCL20	P78556	96 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	IFITM2	Q01629	132 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	TREM1	Q9NP99	234 aa		10.03	□□□□□ -0.8
NOD2-204	ENST00000527052	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TMEM250	H0YL14	139 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	AKR1C3	P42330	323 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	FMC1	Q96HJ9	113 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.02	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	RAB19	A4D1S5	217 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TIRAP	P58753	221 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	C11orf52	Q96A22	123 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	MED9	Q9NWA0	146 aa		10.01	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		10	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		10	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	GNRH2	O43555	120 aa		10	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TYMS	P04818	313 aa		10	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TOR2A	Q5JU69	321 aa		10	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		10	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052		A0A087WTM6	91 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	CIDEA	O60543	219 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	GNG5	P63218	68 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TVP23C	Q96ET8	276 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	SMIM12	Q96EX1	92 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	BIN3	Q9NQY0	253 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	CRYGD	P07320	174 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	UQCC3	Q6UW78	93 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	PSG8	Q9UQ74	426 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NOD2-204	ENST00000527052	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	RHOH	Q15669	191 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	ZNF876P	Q49A33	203 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	PRNT	Q86SH4	94 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	EPM2A	B3EWF7	344 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	GCG	P01275	180 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	GNG4	P50150	75 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	SMUG1	Q53HV7	270 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052		Q86TA4	180 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	PTH2	Q96A98	100 aa		9.95	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	LINC00862	A6NCI5	91 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	RS1	O15537	224 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	LTA	P01374	205 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	NDUFA5	Q16718	116 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	BAGE2	Q86Y30	109 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	SGK494	Q96LW2	274 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	C9orf85	Q96MD7	179 aa		9.94	□□□□□ -0.82
NOD2-204	ENST00000527052	PSCA	O43653	123 aa		9.93	□□□□□ -0.82

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