RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 HLA-DMBP28068 263 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 DLX6P56179 175 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 CDSNQ15517 529 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 Q5XG85 94 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 DTX2Q86UW9 622 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 THAP8Q8NA92 274 aa6.53□□□□□ -1.36
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFA3O95167 84 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ATP5G1P05496 136 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 COX6B1P14854 86 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 OTORQ9NRC9 128 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 F8VRH5 84 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 H3BMM0 161 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-48P01763 117 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF56Q15929 161 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 C4orf26Q17RF5 130 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 UBE2WQ96B02 151 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 RNF185Q96GF1 192 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ORM1P02763 201 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 P0DMU3 169 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 FAM231AP0DMU4 169 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 FAM231CP0DMU5 169 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 WT1-ASQ06250 92 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 PMVKQ15126 192 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00311Q8N616 119 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.52□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 H3BTX0 84 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 OVOL1O14753 267 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 LY6HO94772 140 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TNFRSF6BO95407 300 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV2-23P01705 113 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 Q8N8P6 123 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 CGB1A6NKQ9 187 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 H7C1H1 209 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 LINC01620Q4KN68 170 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 DPH3Q96FX2 82 aa6.51□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF815PA8K554 130 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 GAS8-AS1O95177 125 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 APELAP0DMC3 54 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 COX7CP15954 63 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 OXTP01178 125 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-30P01768 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 SLC25A16P16260 332 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 COX7A1P24310 79 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 KLRB1Q12918 225 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 C2orf48Q96LS8 159 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 AKAP6Q13023 2319 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ITPR1Q14643 2758 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 CNTFRP26992 372 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ADORA2A-AS1P86434 159 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 CFHR4Q92496 578 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 MED13LQ71F56 2210 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 A0A0J9YY99 117 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ATXN8Q156A1 80 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 HCP5Q6MZN7 132 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 J3QLI3 93 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGLV1-47P01700 117 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV3-33P01772 117 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 PRR25Q96S07 402 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 CNFNQ9BYD5 112 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 ELANEP08246 267 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 MALP21145 153 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM258P61165 79 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 PRO0628Q9UI54 55 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-209ENST00000519674 LAGE3Q14657 143 aa6.47□□□□□ -1.37
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