RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF492Q9P255 531 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM189A5PLL7 270 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 RS1O15537 224 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF876PQ49A33 203 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 MDFICQ9P1T7 246 aa4.7□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 H3BVH4 76 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 CCL20P78556 96 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF726P1Q15940 193 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 C12orf74Q32Q52 190 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 C16orf74Q96GX8 76 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 B4DEV8 164 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 Q8NAQ8 132 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 MLST8Q9BVC4 326 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 DKK2Q9UBU2 259 aa4.69□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PAX4O43316 350 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 GNG4P50150 75 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 BLOC1S1P78537 153 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 RPL19P84098 196 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF345Q14585 488 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 AMTNQ6UX39 209 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1W2PRE2 83 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 MGPP08493 103 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SMIM17P0DL12 118 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 CCL18P55774 89 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PRR9Q5T870 116 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 Q6ZSN1 163 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 OR2D3Q8NGH3 330 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TVP23CQ96ET8 276 aa4.68□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1B0GW15 77 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 G3V3Q6 166 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ASIPP42127 132 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNS1Q96KK3 526 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 DERL1Q9BUN8 251 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SPINK4O60575 86 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF253O75346 499 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 GZMBP10144 247 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 RAB5CP51148 216 aa4.67□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 PMCHP20382 165 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF56Q15929 161 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF680Q8NEM1 530 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TCL1AP56279 114 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF727A8MUV8 499 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM262E9PQX1 116 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 CENPWQ5EE01 88 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM162BQ5T6X4 162 aa4.66□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 RBFOX3A6NFN3 312 aa4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 P01737 135 aa4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ERVFC1-1P60608 527 aa4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 ADIRFQ15847 76 aa4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.65□□□□□ -1.66
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE12JA6NER3 117 aa4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 LYRM9A8MSI8 78 aa4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 SH2D1AO60880 128 aa4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE1Q13065 139 aa4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE4Q13068 117 aa4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE5Q13069 117 aa4.65□□□□□ -1.67
RRN3P1-201ENST00000514813 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.65□□□□□ -1.67
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