RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXC2Q99958 501 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 NOTCH2Q04721 2471 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 AGRNO00468 2067 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 NMUP48645 174 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 LAGE3Q14657 143 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 C7orf71A4D174 169 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 MRAP2Q96G30 205 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A1W2PRX2 142 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 K7EQG2 157 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 LGALS9BQ3B8N2 356 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 LGALS9CQ6DKI2 356 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.28□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 DKK2Q9UBU2 259 aa8.27□□□□□ -1.08
RABGEF1-208ENST00000510829 CR1P17927 2039 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A0J9YX75 114 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 LINC01619G3V211 115 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 DEFB131AP59861 70 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 MPV17L2Q567V2 206 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 VPS13CQ709C8 3753 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 MTORP42345 2549 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 A0A087WWL8 130 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TEX29Q8N6K0 151 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP5LO75964 103 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 PEMTQ9UBM1 199 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 KNCNA6PVL3 124 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 LGALS9O00182 355 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 CDKN1BP46527 198 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 NRACQ8N912 160 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 KLLNB2CW77 178 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 J3QKU1 62 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 CD5LO43866 347 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 JPT2Q9H910 190 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM160Q9NX00 188 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 CHD6Q8TD26 2715 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ITPR3Q14573 2671 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 SYT8Q8NBV8 401 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF56Q15929 161 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 CBY3A6NI87 242 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 MED14OSP0DP75 135 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 COX8AP10176 69 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 RASL10AQ92737 203 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 CSTL1Q9H114 145 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 FOXI2Q6ZQN5 318 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 MDFICQ9P1T7 246 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 APCP25054 2843 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 PPP1R17O96001 155 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZSV7 163 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 Q6ZVH6 145 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 IGKCP01834 107 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 Q8N1Y9 231 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 DPM2O94777 84 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 C20orf78Q9BR46 151 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ODF1Q14990 250 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF124Q15973 351 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ERASQ7Z444 233 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
RABGEF1-208ENST00000510829 ZNF876PQ49A33 203 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 RNF152Q8N8N0 203 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ODF3Q96PU9 254 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 KIR2DL4Q99706 377 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 ZFHX3Q15911 3703 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 DLEU1O43261 78 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 VAMP3Q15836 100 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-208ENST00000510829 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.2□□□□□ -1.1
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